21世紀初,日本的生物科技技術高度發達,使得人類的壽命得到了有效的延長,然而聯合國卻稱相關技術存在巨大危害,並且對其實施了嚴格監控。日本政府不肯服從聯合國的決定,決定再次閉關鎖國。 2077年,美國特種部隊「SWORD」所屬女兵VEXILLE偷偷的潛入了封鎖了10年的日本,故事由此展開……