第三次聖杯戰爭中,其中一名當時參戰的魔術師秘密取得了大聖杯,冬木的聖杯戰爭以丟失大聖杯作結。而這個大聖杯在六十年後於羅馬尼亞被發現,千界樹一族打算成立新的魔術協會,召喚了七名代表「黑」方的從者向魔術協會的代表 時鐘塔宣戰 而時鐘塔利用了大聖杯的「非常時期機制」,另外召喚了七名從者。聖杯本身也召喚了一名特殊職階的從者「Ruler」。分成兩大陣營、七騎對七騎的「聖杯大戰」就此開始。