在鋼彈模型對戰世界大賽獲勝的7年後,描述經過時代的演變,鋼彈模型對戰大賽規則也隨之更新,變為3人一組的對戰形式。但是在前代故事中伊織誠所就讀的聖鳳學園鋼彈模型對戰部中,卻僅僅只剩下就讀國中3年級的部長「星野文奈」而已,如果無法招收到新的部員,文奈就無法參加鋼彈模型對戰大賽……。